為使捷運與長程運具間接駁緊密配合，提高民眾對大眾運輸之使用度，高捷公司99年初起試辦捷運紅線首班車提早及延後深夜列車服務時間，以加強服務台鐵及高鐵旅客，廣受各界好評，將續辦至100年8月12日。另因應新學期於8月30日開始，高捷公司自9月1日起恢復提供學生族群於通學時間持用一卡通學生卡之8 折優惠方案，歡迎學生族群多多利用學生卡，或更優惠的幸福卡或漫遊卡搭乘安全環保之大眾運輸工具通學。 為讓旅客順利轉乘高鐵第一班06:30北上列車，高捷公司經多方努力，以更有效率的維修方式有效縮短夜間維修時間，成功安排R3小港站首班車由原06:00提前至05:55發車，R11高雄車站北上列車06:00發車；而R3小港站北上之深夜列車由原23:35延後至23:40；R23橋頭站南下之深夜列車發車時間23:35不變外，另於23:55加發一列深夜列車以供高鐵末班車旅客搭乘。深夜列車提供之服務目前僅限紅線，搭乘深夜列車之旅客無法再轉至橘線搭乘。高捷公司未來會持續蒐集數據及檢討，視運量需求增開橘線深夜轉運列車以提供紅線旅客轉乘。