一、臺鐵沙崙支線即將於100年1月2日（星期日）通車營運，以中洲車站為路線起點，終點為沙崙站，中間設有長榮大學一站，採雙線軌道路線，全長6.52公里。100年1月2日正式通車後至1月15日止辦理免費試乘活動，以讓民眾熟悉利用此支線，通車典禮後之首班列車作為開放免費試乘之首航班次，首航班次資料如下： 下行：3539次南科（15：18開）─沙崙（15：59到）；上行：3534次沙崙（15：00開）─南科（15：40到）。 二、臺鐵沙崙支線通車營運後相關之效益如后： (一)場站整合：為便利旅客轉乘，經由一長約34公尺之通廊，連結臺鐵沙崙站與高鐵臺南站，旅客可直接經由通廊相互轉乘臺鐵或高鐵列車達到不落地轉乘。 (二)運具整合：建構雙鐵轉乘接駁系統，臺鐵局將增開70列次區間車，主要行駛於南科－臺南－沙崙間，提供兩鐵（高鐵及臺鐵）旅客轉乘需求服務，其中臺南－沙崙行車時間將由現行公路班車50分鐘，縮短為22分鐘，以利民眾往來臺南市區及南部科學園區。 (三) 票證整合：為便利旅客轉乘公共運具，臺鐵沙崙支線新設車站均建置有票務自動化設施，包含電腦售票機、自動售票機及多卡通自動驗票閘門；另為因應IC卡交通電子票證之普及，鄰近沙崙支線區間車站（沙崙－臺南－南科）將建構多卡通IC電子票證乘車業務，以利旅客持電子票證，即可搭乘軌道、公車客運等交通工具，增加電子票證的便利性，充分發揮公共運輸整合的功能。 (四)資訊整合：為提供即時訊息，在沙崙站、長榮大學站、中洲站及臺南站建置ITS（智慧型運輸系統Intelligent　Transportation　System）設備，於前述車站及行駛於沙崙支線的列車上，提供高鐵列車班表資訊。並於沙崙站、長榮大學站、中洲站等場站，設置銜接路網圖資訊。另各站並依其地理位置及周邊相關轉乘運具種類，依據旅客轉乘之運具設置公車轉乘資訊、高鐵轉乘資訊。